Departamento de Investigación en Parasitología.

Caracterización Molecular y Genómica Funcional de Tripanosomátidos

Investigador Dr. Franklin SamudioFranklyn Samudio
Investigador

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Es nuestro interés generar nuevos conocimientos mediante el estudio de los trypanosomátidos a nivel molecular para la evaluación y el desarrollo de marcadores moleculares que ayuden en la caracterización molecular de tripanosomátidos y a su vez entender la biología de procesos esenciales como la regulación de la expresión genética con la finalidad de generar conocimiento que ayude a la búsqueda de nuevos blancos terapéuticos y biomarcadores.

Identificación y Caracterización Molecular de Tripanosomátidos

La identificación y caracterización molecular de tripanosomatídeos es fundamental para el estudio de la eco-epidemiología de las enfermedades causadas por estos parásitos, historia natural de la enfermedad, identificar propiedades biológicas vinculadas con patogenicidad, virulencia y resistencia a drogas y distinguir los tripanosomátidos de otros agentes etiológicos que pueden causar enfermedades con cuadros clínicos similares. Actualmente los esfuerzos de nuestro grupo están encaminados a la evaluación de marcadores moleculares existentes como también genes y segmentos genéticos contenidos en los genomas de estos organismos con el propósito de implementar y desarrollar métodos de detección y caracterización molecular de tripanosomátidos que ayuden en la ejecución de estudios sobre la eco-epidemiología de la enfermedad de Chagas y Leishmaniasis en Panamá y en el diagnostico molecular de estas enfermedades vinculado a ensayos clínicos y servicios de referencia.

 

Genómica Funcional

En los tripanosomátidos no se ha comprobado la existencia de promotores para la RNA polimerasa II por lo que se cree que la mayoría de la regulación es post-transcripcional y orquestada por elementos de secuencias contenidos en las regiones no traducidas y proteínas que se ligan a RNA que en conjunto forman regulones post-transcripcionales cuya función es regular la expresión de proteínas funcionalmente relacionadas.  Actualmente nuestro grupo está realizando estudios sobre la transcripción de genes esenciales utilizando como modelo el locus de calmodulina del Trypanosoma cruzi y Leishmania spp. Dentro de esta línea investigamos las isoformas generadas por los procesos de trans-splicing y poliadenilación alternativa durante la transcripción del locus de calmodulina, la composición de sus regiones no traducidas y la identificación de elementos de secuencia que podrían estar vinculados en la regulación de la expresión genética.

Publicaciones Relevantes

  • Calmodulin Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism for Leishmania Identification and Typing. Miranda A., Samudio F, González K.,  Saldaña A., Brandao A., Calzada JE.Am J Trop Med Hyg. 2016 Aug 3;95(2):383-7. doi: 10.4269/ajtmh.15-0709.
  • The calmodulin intergenic spacer as molecular target for characterization of Leishmania species. Miranda A, Samudio F, Saldaña A, Castillo J, Brandão A, Calzada JE. Parasit Vectors. 2014 Jan 19;7:35. doi: 10.1186/1756-3305-7-35.
  • Cell disruption using a different methodology for proteomics analysis of Trypanosoma cruzi strains. Silva Galdino T, Menna-Barreto RF, Britto C, Samudio F, Brandão A, Kalume DE. Anal Biochem. 2014 Mar 1;448:1-8. doi: 10.1016/j.ab.2013.11.010. Epub 2013 Nov 27.
  • Genotyping of Panamanian Trypanosoma cruzi stocks using the calmodulin 3’UTR polymorphisms. Brandao A, Samudio F, Fernandes O, Calzada JE, Sousa OE. Parasitol Res. 2008 Feb;102(3):523-6. Epub 2007 Dec 29.
  • Molecular epidemiology of American tegumentary leishmaniasis in Panama. Miranda A, Carrasco R, Paz H, Pascale JM, Samudio F, Saldaña A, Santamaría G, Mendoza Y, Calzada JE. Am J Trop Med Hyg. 2009 Oct;81(4):565-71.
  • Predominance of Trypanosoma cruzi I among Panamanian sylvatic isolates. Samudio F, Ortega-Barría E, Saldaña A, Calzada J. Acta Trop. 2007 Feb;101(2):178-81.
  • Molecular characterization of human Trypanosoma cruzi isolates from endemic areas in Panama. Sousa OE, Samudio F, de Juncá C, Calzada JE. Mem Inst Oswaldo Cruz. 2006 Jun;101(4):455-7.
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Lic. Vanesa Pineda

Co-Investigadora

vpineda@gorgas.gob.pa

Yeraldy Lorell

estudiante de Licenciatura, UP

 

Michelle Davila

estudiante de maestría , UP